Projekte Computergestützte Virologie

Genetische Determinanten der schweren RSV Infektion in Kleinkindern
Das menschliche Virom als Faktor für Gesundheit und Krankheit
Publikationen
Das RNA-Virom in Wirbeltieren
Zusätzlich zur Studie über das menschliche Virom werden wir unseren bioinformatischen Workflow auf Tierproben anwenden, um unbekannte Verwandte wichtiger menschlicher Krankheitserreger zu entdecken. Wir werden unsere Analysen in diesem Projekt auf RNA Viren fokussieren, insbesondere auf solche, die beim Menschen chronische Infektionen verursachen können. Zum Beispiel werden wir nach neuen Viren suchen, die nah mit den Hepadna-, Hepaci-, Hepe- und Deltaviren verwandt sind, welche beim Menschen Lebererkrankungen verursachen. Obwohl wir hauptsächlich an Säugetierviren interessiert sind, werden wir auch nach neuen Viren anderer Wirbeltierarten suchen, da auch Letztere wertvolle Einblicke in die Evolution ihrer Verwandten im Menschen geben können. Geeignete Kandidatenviren werden von unseren Kollaborationspartnern experimentell charakterisiert. Eines unserer langfristigen Ziele ist es, die Grundlage für Tierinfektionsmodelle zu schaffen.
Publikationen
Das menschliche Virom als Faktor für Gesundheit und Krankheit
Lauber C*, Seitz S*, Mattei S, Suh A, Beck J, Herstein J, Börold J, Salzburger W, Kaderali L, Briggs JAG, Bartenschlager R. Deciphering the Origin and Evolution of Hepatitis B Viruses by Means of a Family of Non-enveloped Fish Viruses. Cell Host Microbe. 2017 Sep 13;22(3):387-399
van Boheemen S, de Graaf M, Lauber C, Bestebroer TM, Raj VS, Zaki AM, Osterhaus AD, Haagmans BL, Gorbalenya AE, Snijder EJ, Fouchier RA. Genomic Characterization of a Newly Discovered Coronavirus Associated With Acute Respiratory Distress Syndrome in Humans. mBio. 2012 Nov 20;3(6):e00473-12
van der Meijden E, Janssens RW, Lauber C, Bouwes Bavinck JN, Gorbalenya AE, Feltkamp MC. Discovery of a New Human Polyomavirus Associated With Trichodysplasia Spinulosa in an Immunocompromized Patient. PLoS Pathog. 2010 Jul 29;6(7):e1001024
Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses. The Species Severe Acute Respiratory Syndrome-Related Coronavirus: Classifying 2019-nCoV and Naming It SARS-CoV-2. Nat Microbiol. 2020 Apr;5(4):536-544
*geteilte Autorenschaft
Das RNA-Virom in Wirbeltieren
Lauber C, Seifert M, Bartenschlager R, Seitz S. Discovery of Highly Divergent Lineages of Plant-Associated Astro-Like Viruses Sheds Light on the Emergence of Potyviruses. Virus Res. 2019 Jan 15;260:38-48
Lauber C*, Seitz S*, Mattei S, Suh A, Beck J, Herstein J, Börold J, Salzburger W, Kaderali L, Briggs JAG, Bartenschlager R. Deciphering the Origin and Evolution of Hepatitis B Viruses by Means of a Family of Non-enveloped Fish Viruses. Cell Host Microbe. 2017 Sep 13;22(3):387-399
Nga PT*, Parquet Mdel C*, Lauber C*, Parida M, Nabeshima T, Yu F, Thuy NT, Inoue S, Ito T, Okamoto K, Ichinose A, Snijder EJ, Morita K, Gorbalenya AE. Discovery of the First Insect Nidovirus, a Missing Evolutionary Link in the Emergence of the Largest RNA Virus Genomes. PLoS Pathog. 2011 Sep;7(9):e1002215